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hyperbiotics从天然物中提取的益生元如棉子糖是从甜菜汁或甜菜废糖蜜中提取，水苏糖是植物泽兰中提取，大豆低聚糖从去除大豆蛋白之大豆乳清中提取，此外从胡萝b中可提取出含氮多糖及低聚糖等双歧因子。从牛奶或胰脏用木瓜蛋白酶或胃蛋白处理可得肽类双歧因子。用酸水解多糖制造功能性低聚糖，因酸水解无专一性，产品中糖类复杂，不易得到特定的低聚糖，工业上大量生产的益生元是利用生物技术的酶法水解或转移反应制造的。